高新企業(yè)申報中涉及研發(fā)的方面有：研發(fā)管理水平和認定條件中的研發(fā)費用占比情況，這也是評審中影響較大的一塊，很多企業(yè)在高新技術(shù)企業(yè)認定過程中都會在研發(fā)這一塊出現(xiàn)問題，下面給大家具體分析一下。

一、研發(fā)活動問題

研發(fā)活動問題一方面是企業(yè)引起的，一方面是認定機構(gòu)導致的。企業(yè)的問題是有些公司缺乏研發(fā)領(lǐng)域的專家，再加上研發(fā)項目的資源不足，導致開展的研發(fā)活動沒能順利進行，錯過了高新企業(yè)申報時機；認定機構(gòu)的問題是對企業(yè)的研發(fā)活動難以認定，如企業(yè)是否通過研究開發(fā)活動在技術(shù)、工藝、產(chǎn)品（服務）方面的創(chuàng)新取得了有價值的成果，是否對本地區(qū)相關(guān)行業(yè)的技術(shù)、工藝領(lǐng)先具有推動作用。

二、高新企業(yè)申報研發(fā)費用歸集問題

1、在現(xiàn)實中，存在一些尚未設(shè)立專門研發(fā)機構(gòu)的企業(yè)，這些企業(yè)在核算和歸集研發(fā)費用沒法做到合理無誤，對可以進行加計扣除政策的研發(fā)費用難以確定；

2、工作指引中較明確規(guī)定了直接投入的開支范圍，但企業(yè)實際操作中會出現(xiàn)研發(fā)費中的材料費品種繁多，部分領(lǐng)料單上亦未寫明具體用于什么研究開發(fā)項目的情況；

3、很多申報高新企業(yè)的企業(yè)，特別是中小型企業(yè)，并沒有獨立設(shè)置研發(fā)費用科目，將發(fā)生的研發(fā)費分別記錄在不同的會計科目上，導致無法核算研發(fā)項目的研發(fā)費用。

三、委托研發(fā)費用真實性難以核實

企業(yè)研發(fā)費用稅前扣除有規(guī)定，如果企業(yè)委托給外部單位進行研發(fā)，受托方應提供該研發(fā)費用支出明細情況。但受托方提供資料的真實性難以保證，稅務部門如果不進行延伸檢查，就無法辨別真實性。特別是當受托方為異地注冊的企業(yè)，稅務部門會受行政管轄權(quán)的限制。